A co widać w panelu admina w Record Browser?
Od kiedy się tak dzieje? Może coś namieszałeś z uprawnieniami?
Przede wszystkim phpmyadmin is your friend - trzeba zobaczyć tzw. raw data.
W Epesi jak wiesz nic nie jest usuwane - tylko bit aktywności rekordu jest ustawiany na 0/1 i każda zmiana w rekordzie jest zapisywana w historii. Więc danych na pewno nie straciłeś.